提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

　　近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。

　　全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

　　统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

　　相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

　　该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

　　与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。

　　该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

政协重庆市第六届委员会第一次会议开幕******

　　中新网重庆1月12日电 (刘相琳 杨梦逸)中国人民政治协商会议重庆市第六届委员会第一次会议12日在重庆开幕。本次会议为期4天，共有八项议程。中共中央政治局委员、重庆市委书记袁家军出席开幕会并讲话。

　　袁家军在开幕会上表示，五年来，全市政协系统围绕中心、服务大局，发扬民主、增进团结，政治建设有新成效，建言资政有新成果，凝心聚力有新办法，特色品牌有新亮点，自身建设有新进步，为全市大局展现了政协担当、发挥了政协作用、作出了政协贡献。

　　袁家军指出，当前和今后一个时期，要坚持党的领导、统一战线、协商民主有机结合，坚持团结、民主两大主题，坚持围绕中心、服务大局，不断提高政治协商、民主监督、参政议政水平，为新时代新征程全面建设社会主义现代化新重庆开好局起好步贡献更大的政协力量。

　　在开幕会上，王炯代表政协重庆市第五届委员会常务委员会作工作报告时指出，五年来，重庆市政协紧扣中心大局，聚焦重点任务，就加快现代化产业体系建设，专精特新企业发展，数字经济发展，智造重镇建设等议政建言。引导委员紧扣全市“双稳” 相关工作自主调研2000 余人次，提出建议 800 余条。邀请委员和专家登上“智汇经济圈”舞台，围绕助力重庆新能源和智能汽车高质量发展、西部金融中心打造等建诤言、献良策。

　　工作报告称，五年来，重庆市政协助推内陆开放高地建设实现新的突破。持续跟进协商中新互联互通项目建设问题，围绕打造长江上游航运中心、建设中西部国际交往中心等深入研究，举办西部陆海新通道沿线“13+1”省区市政协联合协商，履职成果转化为全国两会联名提案和会议发言，一些建议被国家有关规划采纳。

　　在助推成渝地区双城经济圈建设方面，重庆市政协组织委员就“加快建设具有全国影响力的科技创新中心”提出建议1300余条。组织视察调研，助力构建“一区两群”区域协调发展格局。加强同四川省政协联系合作，组织住川渝全国政协委员提交联名提案，《关于支持建设川渝自贸试验区协同开放示范区的提案》被列为全国政协重点提案办理。分年度就共建西部科学城等开展联合履职。支持川渝毗邻地区政协合作。川渝政协共助渝昆高铁建设。

　　陈贵云代表政协重庆市第五届委员会常务委员会作提案工作情况报告时表示，五届重庆市政协期间，广大政协委员、政协各参加单位和各专门委员会共提交提案7596件。经审查，立案6237件，并案后交办5286件。提案聚焦国之大者、民之关切，内容丰富、涉及面广、质量较高。所有交办提案均已按时办结。一大批提案建议为重庆市委和市政府科学民主决策起到了重要参考作用，展现了人民政协作为专门协商机构在推进全过程人民民主中的重要作用。(完)